中藥丹參的活性成分——丹參酮類化合物為一系列松香烷類去甲二萜醌類化合物,目前主要通過從丹參根莖中提取得到,產(chǎn)量低,需要消耗大量藥材。由于提取物成份復(fù)雜,不利于闡明藥效機(jī)制和新藥研發(fā)。因此,解析丹參酮的生物合成途徑,進(jìn)行單一化合物的異源生產(chǎn),具有重要科學(xué)意義和應(yīng)用價值。中國中醫(yī)科學(xué)院中藥研究所黃璐琦研究員團(tuán)隊此前鑒定了兩個酶SmCPS和SmKSL,具有轉(zhuǎn)化香葉基香葉基焦磷酸(GGPP)合成丹參酮前體二萜化合物次丹參酮二烯的功能,并發(fā)現(xiàn)這兩個蛋白可能存在分子間相互作用。
在楊勝利院士建議下,我所趙宗保研究員與黃璐琦研究員合作,以丹參酮為目標(biāo),開展合成生物學(xué)理念指導(dǎo)下的萜類化合物異源生物合成研究??蒲腥藛T建立了“模塊途徑工程”策略,可在酵母細(xì)胞中快速組裝代謝途徑。在此基礎(chǔ)上,通過設(shè)計模塊組合方式,系統(tǒng)考慮途徑中涉及的前體供給、限速步驟、底物傳輸和代謝流分配等問題,對編碼SmCPS、SmKSL、法呢基焦磷酸合酶、GGPP合酶和甲羥戊酸還原酶等五個蛋白的基因進(jìn)行了操作,最優(yōu)的工程菌株在15-L發(fā)酵罐中培養(yǎng),次丹參酮二烯產(chǎn)量達(dá)到365mg/L的國際先進(jìn)水平。
在該項研究中,大連化物所李國輝研究員領(lǐng)導(dǎo)的分子模擬與設(shè)計研究組(1106組)對SmCPS和SmKSL融合蛋白的結(jié)構(gòu)進(jìn)行了分子模擬,發(fā)現(xiàn)不同融合方式導(dǎo)致催化中心空間距離差異,為解釋代謝途徑的性能提供了理論支持。
本工作得到的菌株不僅可用于制備次丹參酮二烯,奠定了進(jìn)一步解析丹參酮生物合成途徑的基礎(chǔ),而且對設(shè)計和改造萜類化合物代謝途徑,生產(chǎn)液體生物燃料和其他高值生物基化學(xué)品具有重要借鑒意義。
該研究得到了國家自然科學(xué)基金委和我所科研創(chuàng)新基金的資助。