日前，由中科院海洋所宋林生研究員課題組承擔(dān)的“河鲀雜交優(yōu)勢機(jī)制的轉(zhuǎn)錄組解析”研究取得重要進(jìn)展，相關(guān)研究成果在PLoS ONE上發(fā)表。
科研人員依托基因資源研究平臺，使用SOLiD 4第二代高通量測序儀，通過對紅鰭東方鲀、菊黃東方鲀及其雜交后代“冀研一號”的全轉(zhuǎn)錄組測序分析，獲得了總長超過12 Gbp的序列，覆蓋44,305個(gè)轉(zhuǎn)錄本。同時(shí)，科研人員還對14,148個(gè)差異表達(dá)轉(zhuǎn)錄本進(jìn)行比較分析，初步確定了超過兩千個(gè)雜交優(yōu)勢候選基因，得到了35條與雜交優(yōu)勢有關(guān)的KEGG通路，發(fā)現(xiàn)“冀研一號”的基因表達(dá)模式分別符合顯性效應(yīng)、超顯性效應(yīng)及累加效應(yīng)，由此推測“冀研一號”的雜交優(yōu)勢是由多種效應(yīng)共同存在所決定的，證明了雜交東方鲀中存在大量的新轉(zhuǎn)錄剪切形式，具有離子結(jié)合、核酸結(jié)合及激酶催化等多種功能，這些新發(fā)現(xiàn)的轉(zhuǎn)錄剪接體同樣可能與雜交優(yōu)勢密切相關(guān)。
該項(xiàng)研究完全依托中科院海洋所自主構(gòu)建的海洋生物基因資源平臺和超算平臺獨(dú)立完成，獲取的轉(zhuǎn)錄組信息，為從基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的角度理解雜交優(yōu)勢形成和調(diào)節(jié)機(jī)制提供了重要數(shù)據(jù)資源，也為雜交優(yōu)勢的應(yīng)用提供了理論指導(dǎo)。
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http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0058453
