近日，中科院大連化學(xué)物理研究所王方軍博士、鄒漢法研究員等人在高通量多重蛋白質(zhì)組定量分析方法研究方面取得新進(jìn)展，發(fā)展了一級質(zhì)譜（MS1）譜圖中六種不同蛋白質(zhì)樣品同時(shí)規(guī)?；糠治龅耐凰貥?biāo)記方法，并將該方法應(yīng)用于細(xì)胞蛋白質(zhì)合成-降解周轉(zhuǎn)更新分析，分析通量是常規(guī)同位素標(biāo)記方法的三倍，研究成果發(fā)表在自然出版社新創(chuàng)立的綜合性刊物《科學(xué)報(bào)告》上（Scientific Reports, 2013, 3, 1827. doi: 10.1038/srep01827, http://www.nature.com/srep/2013/130510/srep01827/full/srep01827.html）。
基于一級質(zhì)譜（MS1）的蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析由于定量精度高，是現(xiàn)今蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析中應(yīng)用最為廣泛的分析技術(shù)。由于同位素標(biāo)記的限制，現(xiàn)有的方法最多可以在一次液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析中定量三種不同的蛋白質(zhì)樣品，極大限制了蛋白質(zhì)組學(xué)定量分析的通量。王方軍博士、鄒漢法研究員等人將體內(nèi)氨基酸同位素標(biāo)記方法與體外二甲基化同位素標(biāo)記方法進(jìn)行有機(jī)組合，實(shí)現(xiàn)了六種不同蛋白質(zhì)樣品的差異標(biāo)記并在單次實(shí)驗(yàn)中實(shí)現(xiàn)了相對定量分析。該六重同位素標(biāo)記策略還可以應(yīng)用于細(xì)胞中蛋白質(zhì)的合成及降解速率的高通量分析，成功測定了HeLa細(xì)胞中1365個(gè)蛋白質(zhì)的合成-降解周轉(zhuǎn)更新時(shí)間。此外，該工作中使用的基于MS1六重蛋白質(zhì)組學(xué)定量及蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)分析軟件系統(tǒng)也由我所自主開發(fā)，是國際上首個(gè)可以同時(shí)定量六個(gè)不同蛋白質(zhì)樣品的軟件系統(tǒng)。
Quant-ArMone 六重蛋白質(zhì)組學(xué)定量及蛋白質(zhì)周轉(zhuǎn)分析軟件示意圖
HeLa細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解動(dòng)態(tài)擬合曲線示例
