微藻通過光合作用，在地球生物圈的碳固定、初級生物量積累和能量轉(zhuǎn)化等方面發(fā)揮著重要作用。一些具有含油量高、生長速度快、抗逆性強(qiáng)等生理特征的微藻，具備規(guī)模生產(chǎn)生物柴油等可再生燃料的潛力。而目前使用的ITS等系統(tǒng)發(fā)育分子標(biāo)記經(jīng)常無法準(zhǔn)確區(qū)分與鑒定種內(nèi)不同藻株或?qū)賰?nèi)不同藻種。因此，開發(fā)高靈敏度和高可靠性的微藻系統(tǒng)發(fā)育分子標(biāo)記具有重要意義。
近日，中國科學(xué)院青島生物能源與過程研究所功能基因組團(tuán)隊(duì)博士研究生魏力、辛一等人以一類高含油的海水微藻微擬球藻（Nannochloropsis）為模式，通過對Nannochloropsis屬內(nèi)的6個(gè)已知藻種共7個(gè)藻株的葉綠體和線粒體基因組進(jìn)行完整測序和精細(xì)比較，首次系統(tǒng)評價(jià)了微藻細(xì)胞器基因組上所有編碼和非編碼DNA片段作為潛在系統(tǒng)發(fā)育分子標(biāo)記的性能，發(fā)現(xiàn)與現(xiàn)有分子標(biāo)記相比，種質(zhì)區(qū)分和鑒定的靈敏度和可靠性均顯著提高的一系列新的系統(tǒng)發(fā)育分子標(biāo)記。據(jù)此，提出了一種在微藻屬內(nèi)進(jìn)行精確種質(zhì)鑒定的新策略（圖1）。該研究成果已在線發(fā)表于BMC Genomics。
上述研究由該團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人徐健研究員主持，聯(lián)合美國亞利桑那州立大學(xué)胡強(qiáng)教授團(tuán)隊(duì)和美國馬里蘭大學(xué)陳峰教授團(tuán)隊(duì)共同完成，并得到了中科院創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)國際合作伙伴計(jì)劃和太陽能行動計(jì)劃的支持。
圖1 一種在微藻屬內(nèi)進(jìn)行精確種質(zhì)鑒定的新策略
1. Nannochloropsis plastid and mitochondrial phylogenomes reveal organelle diversification mechanism
and intragenus phylotyping strategy in microalgae, BMC Genomics.2013, 14:534.DOI: 10.1186/10.1186
/1471-2164-14-534; URL: http://www.biomedcentral.com/1471-2164/14/534 （功能基因組團(tuán)隊(duì)供稿）
