青島能源所微生物代謝工程研究組前期圍繞藍(lán)細(xì)菌糖原代謝調(diào)控策略,以及糖原代謝擾動(dòng)對(duì)藍(lán)細(xì)菌生理和代謝功能影響的研究取得了系列成果,在此基礎(chǔ)上,近期該研究組在生物技術(shù)領(lǐng)域重要綜述期刊Biotechnology Advances上發(fā)表了題為“Progress and perspective on cyanobacterial glycogen metabolism engineering”的綜述論文,對(duì)藍(lán)細(xì)菌糖原代謝工程的進(jìn)展和前景進(jìn)行了系統(tǒng)的總結(jié)和展望。
基于對(duì)藍(lán)細(xì)菌糖原代謝工程改造靶點(diǎn)、改造策略、以及生理和代謝功能影響的全面總結(jié),微生物代謝工程研究組的研究人員提出,隨著合成生物學(xué)和代謝工程策略和工具的不斷開發(fā)和優(yōu)化,對(duì)藍(lán)細(xì)菌糖原代謝(合成、降解和儲(chǔ)備)的調(diào)控技術(shù)已經(jīng)非常成熟。然而,在此基礎(chǔ)上要全面深入的認(rèn)識(shí)藍(lán)細(xì)菌糖原代謝的生理代謝功能,進(jìn)而開發(fā)出能夠有效優(yōu)化細(xì)胞工廠效能的藍(lán)細(xì)菌糖原代謝工程策略則仍有很長(zhǎng)的路要走。如圖1所示,糖原代謝對(duì)藍(lán)細(xì)菌細(xì)胞生理和代謝功能的影響可以總結(jié)為兩個(gè)方面:(1)作為最主要的天然碳匯機(jī)制,吸收光合固碳的“溢出”部分,保持光合碳流-能量流“輸入”和“輸出”的動(dòng)態(tài)平衡;(2)作為重要的生理保護(hù)機(jī)制,促進(jìn)細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)的維持。藍(lán)細(xì)菌光合細(xì)胞工廠中,簡(jiǎn)單的阻斷糖原合成、移除糖原儲(chǔ)備,會(huì)抑制藍(lán)細(xì)菌光合效能、降低藍(lán)細(xì)菌生理和代謝魯棒性,最終限制目標(biāo)代謝產(chǎn)物合成能力的提升。未來,在糖原代謝擾動(dòng)的基礎(chǔ)上,對(duì)人工引入的代謝模塊進(jìn)行針對(duì)性設(shè)計(jì),驅(qū)動(dòng)細(xì)胞中能量-還原力、氧化-還原、光合-光呼吸等生理和代謝狀態(tài)重平衡的實(shí)現(xiàn),輔之以細(xì)胞生理保護(hù)機(jī)制的改造和強(qiáng)化,將有望實(shí)現(xiàn)對(duì)光合碳流真正有效的優(yōu)化和控制,進(jìn)而大幅提高藍(lán)細(xì)菌光合生物制造的效能。
近期,微生物代謝工程研究組還應(yīng)邀在生物技術(shù)領(lǐng)域另一重要期刊Current Opinion in Biotechnology上發(fā)表了題為“Engineering cyanobacteria chassis cells toward more efficient photosynthesis”的觀點(diǎn)性綜述論文,對(duì)面向未來光合生物制造需求的藍(lán)細(xì)菌合成生物技術(shù)底盤細(xì)胞的設(shè)計(jì)原則、改造策略和發(fā)展方向進(jìn)行了總結(jié)和展望。
在過去的二十年間,藍(lán)細(xì)菌光合生物制造技術(shù)在概念上已經(jīng)得到充分驗(yàn)證,已經(jīng)實(shí)現(xiàn)了基于藍(lán)細(xì)菌光合底盤的數(shù)十種天然或非天然代謝產(chǎn)物的光驅(qū)固碳合成。然而,目前藍(lán)細(xì)菌光合細(xì)胞工廠無論是產(chǎn)量還是生產(chǎn)強(qiáng)度上較之經(jīng)典的異養(yǎng)細(xì)胞工廠(大腸桿菌、酵母、乳酸菌、枯草芽孢桿菌等)都有著數(shù)量級(jí)的差距。從根本上分析,藍(lán)細(xì)菌光合細(xì)胞工廠效能受制于其底盤細(xì)胞光合固碳系統(tǒng)的效率,高效的光合作用對(duì)于解鎖藍(lán)細(xì)菌光合細(xì)胞工廠的合成潛能至關(guān)重要。近年來,海量系統(tǒng)生物學(xué)數(shù)據(jù)的快速積累和高效合成生物技術(shù)工具的開發(fā)為藍(lán)細(xì)菌底盤細(xì)胞光合固碳系統(tǒng)的功能認(rèn)識(shí)和系統(tǒng)改造打開了大門,具有高溫高光耐受能力和快速生長(zhǎng)能力的新型藍(lán)細(xì)菌藻株的發(fā)現(xiàn)和鑒定也為光合系統(tǒng)改造策略的設(shè)計(jì)提供了更多可借鑒的思路。微生物代謝工程研究組的研究人員比較、分析了上述兩方面的最新研究進(jìn)展,從光能捕集利用和二氧化碳固定轉(zhuǎn)化兩個(gè)層次,系統(tǒng)總結(jié)了“拓寬吸收光譜”、“提高強(qiáng)光耐受能力”、“提高光能傳遞和利用效率”、“加強(qiáng)碳源吸收能力”、“強(qiáng)化碳源固定效率”“減少碳代謝損失”等六種提高藍(lán)細(xì)菌底盤細(xì)胞光合固碳能力的工程策略(圖2)。進(jìn)而提出,著眼未來大規(guī)模工業(yè)化體系下的藍(lán)細(xì)菌工程藻株的培養(yǎng)和應(yīng)用,除了從“硬件”角度升級(jí)光合作用系統(tǒng)的組分和途徑外,還應(yīng)該從“軟件”角度考慮發(fā)展快速感知和智能響應(yīng)系統(tǒng),使藍(lán)細(xì)菌底盤細(xì)胞和工程藻株可以針對(duì)多變、嚴(yán)苛的環(huán)境條件進(jìn)行柔性適應(yīng),差異性的激活與之適配的光合固碳模式,實(shí)現(xiàn)光合固碳和定向合成的動(dòng)態(tài)平衡,最大化的提升光合細(xì)胞工廠合成產(chǎn)出。
圖1. 藍(lán)細(xì)菌糖原代謝的生理和代謝功能
圖2. 藍(lán)細(xì)菌光合固碳能力的改造和認(rèn)識(shí)策略
相關(guān)研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金、山東省自然科學(xué)基金重大基礎(chǔ)研究項(xiàng)目以及中科院先導(dǎo)專項(xiàng)等項(xiàng)目的支持。(文/圖 欒國(guó)棟)
參考文獻(xiàn):
1. Guodong Luan*, Shanshan Zhang, Min Wang, Xuefeng Lu*, 2019, Progress and perspective on cyanobacterial glycogen metabolism engineering, Biotechnology Advances, https://doi.org/10.1016/j.biotechadv.2019.04.005.
原文鏈接:
https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0734-9750(19)30064-3
2. Guodong Luan#,Shanshan Zhang#,Xuefeng Lu*, 2019, Engineering cyanobacteria chassis cells toward more efficient photosynthesis, Current Opinion in Biotechnology, doi: 10.1016/j.copbio.2019.07.004.
原文鏈接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0958166919300473?via%3Dihub.