近日，中國科學院海洋研究所宋林生研究員研究團隊繪制完成菊黃東方鲀基因組草圖。
菊黃東方鲀俗稱“滿天星”（圖A），隸屬鲀形目、東方鲀科，在亞洲有著悠久的食用歷史和極高的經(jīng)濟價值，也是我國重要的河鲀養(yǎng)殖品種之一。科研人員依托中科院海洋所自主構(gòu)建的海洋生物基因資源平臺和超算平臺獨立完成了菊黃東方鲀（Takifugu flavidus）全基因組的測序、拼裝及分析，利用SOLiD 4第二代高通量測序儀測序得到總長度76.0 Gb的序列，并創(chuàng)新性地采用“輔助拼接”策略拼接獲得scaffolds 50,947條（scaffold N50為305,741 bp）。研究發(fā)現(xiàn)菊黃東方鲀基因組在GC含量和重復序列等多方面與紅鰭東方鲀基因組相似，菊黃東方鲀基因組中共有30,285個蛋白編碼基因，蛋白平均長度為519.9個氨基酸，獲得51,990條GO注釋信息（圖B~D），117 條KEGG通路信息和270,803條InterPro注釋信息。
該項研究積累了東方鲀屬魚類的遺傳背景資料，為深度發(fā)掘海洋動物功能基因、開展蛋白功能的高效驗證分析奠定了基礎(chǔ)。相關(guān)研究結(jié)果在DNA Research發(fā)表（全文鏈接http://dnaresearch.oxfordjournals.org/content/early/2014/07/22/dnares.dsu025.long ）。
